SSP
Science-Support-Plattform
Proteomik
Das Proteomik-Labor am IGZ bietet eine umfassende proteomische Infrastruktur für die Identifizierung und Charakterisierung von Proteinen und Peptiden, in deren Mittelpunkt die hochauflösende und massengenaue Massenspektrometrie steht.
Proteine werden aus In-Gel- oder In-Solution-Proben identifiziert und durch markierungsfreie oder stabile Isotopenmarkierung quantifiziert. Die Identifizierung von posttranslationalen Modifikationen an gereinigten Proteinen oder in komplexen Gemischen wird ermöglicht. In einer Reihe von Projekten werden Methoden für die gezielte und nicht gezielte Proteom-Analyse von Pflanzengeweben und subzellulären Strukturen wie mikrosomalen Membranen, Plasmamembranen, apoplastischer Flüssigkeit und Einzelzellanalysen entwickelt.
Metabolomik LC-MS
Die LC-MS-basierte Metabolomik-Einrichtung unterstützt das Institut und seine Forschungspartner*innen mit modernsten Geräten und Verfahren für die chemische Analyse der resultierenden Proben und Extrakte aus einer Vielzahl von Organismen und Geweben. Diese reichen von Mikroorganismen bis hin zu Pflanzen, einschließlich Blättern, Stängeln, Blüten, Pollen, Wurzeln, Sprossen, Samen, Körnern, Früchten, Bläschen und Exsudaten. Die Flüssigchromatographie-Massenspektrometrie (LC-MS) ist eine vielseitige Analyseplattform und ein leistungsfähiges Instrument für die zielgerichtete und nicht zielgerichtete Analyse von thermolabilen instabilen Verbindungen, polaren und relativ unpolaren Verbindungen, Sekundärmetaboliten und Phytohormonen.
Metabolomik GC-MS
Das Gaschromatographie-Massenspektrometrie-Labor (GC-MS) am IGZ bietet eine umfassende Infrastruktur für die Identifizierung und Analyse von pflanzlichen flüchtigen organischen Verbindungen (volatile organic compounds, VOC).
Pflanzen emittieren ein breites Spektrum chemischer Verbindungen aus verschiedenen Teilen wie Blättern, Blüten und Wurzeln. Diese lipophilen Verbindungen werden hauptsächlich mit dem Ziel freigesetzt, um mit anderen Pflanzen und weiteren Organismen zu kommunizieren.
Bioinformatik
Die Bioinformatik am IGZ ist verantwortlich für die IT-basierte Integration und Analyse komplexer biologischer Datensätze. Mit einem Schwerpunkt auf der Analyse von komplementären Multi-Omics-Daten bieten wir individuelle Lösungen, die ein systemisches Verständnis der Interaktionen zwischen Pflanze und Umwelt sowie der Stressreaktionen ermöglichen. Wir unterstützen dabei die Forschung in den Bereichen Genomik, Transkriptomik, Proteomik, Phenomik sowie Metabolomik.